イベント詳細

【第16回GENESIS講習会】

日時: 2017年1月13日(金) 10:00-16:00
場所:計算科学振興財団(FOCUS) (神戸市中央区)
主催:理化学研究所 計算科学研究機構
担当者:杉田有治(理研)
共催:計算科学振興財団(FOCUS), 高度情報科学技術研究機構(RIST)

概要:「GENESIS」は主に生体分子の分子動力学計算を行うソフトウェアです(計画班員の杉田有治を中心に主に理研で開発)。全原子モデルによる超並列分子動力学計算を行う"SPDYN"と全原子・粗視化モデルによる拡張アンサンブル計算や分子動力学計算を行う"ATDYN"の二つのプログラムにより、細胞規模のシミュレーションから生体内反応の自由エネルギー計算まで幅広い研究をサポートします。講習会では、午前中に簡単な講義、午後は実習形式でタンパク質シミュレーション・自由エネルギー計算の手法を講習しました。

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